大多数致病遗传变异是由碱基点突变、插入或缺失突变引起的,因此,探索如何在活细胞内修复这些突变以恢复正常细胞功能,一直是生命科学的一个长期目标。近年来,一种不需双链断裂和供体模板的新型基因编辑工具——引导编辑(Prime Editing, PE)逐渐崭露头角。PE展现了纠正致病突变和插入保护性等位基因的巨大潜力。初代引导编辑的效率相对较低,David Liu团队对此进行了系统性改进,对pegRNA进行优化,并取得了良好效果。
在David Liu团队最新的研究中,通过优化双AAV载体系统,他们成功实现了小鼠脑、肝、心等多个器官的高效Prime编辑,为基因治疗提供了新的技术手段。接下来,让我们一同探讨v3emPE系统的功能表现。
v3emPE-AAV双载体系统设计
v3emPE引导编辑系统由向导RNA(epegRNAs)引导,由逆转录酶MMLV与nCas9构成的融合蛋白辅助,使其可实现目标位点碱基的精准编辑(替换、插入、删除)。此系统主要包含三个组分:epegRNAs、逆转录酶MMLV和nCas9。然而,MMLV与nCas9的编码蛋白序列长度约为63kb,超出了AAV载体的包装限制(47kb)。为了突破这一限制,v3emPE与分裂型内含肽(intein)结合,设计成双AAV载体系统:在nCas9的第1024位置拆分PE编码序列,分别与源自念珠藻的NpuDnaB快速剪接内含肽的两端融合,构建在两个AAV载体上。共转染这两个AAV后,内含肽通过自剪切作用重新组合成完整的PE蛋白,恢复编辑功能。
v3emPE-AAV双载体系统的改进
1. 启动子升级:使用强效启动子Cbh替代传统的EFS启动子,大幅提升PE蛋白的表达水平。
2. epegRNA稳定化:在传统peekRNA的3′端添加tevopreQ1修饰及8nt链接序列,显著提升了pegRNA的稳定性、编辑效率和特异性;相比传统pegRNA,这些优化后的epegRNA的编辑效率提高了15-40倍。
3. 编辑策略:使用高保真度的引导RNA(epegRNA)和单导向nicking sgRNA(sgRNA)来指导PE到目标DNA位点(sgRNA设计距离编辑位点40-90nt)。
v3emPE-AAV双载体系统的应用
PCSK9Q152H是被称为“天然保护突变”的基因,通过降低LDL-C水平显著减少冠状动脉疾病的风险,同时没有明显的不良反应,因而被视为“有益突变”。相关文献中,利用v3emPE-AAV双载体系统,成功在成年小鼠的肝脏中实现31%和38%的精准编辑;与未处理的小鼠相比,实验小鼠的总血浆胆固醇水平降低了20%,低密度脂蛋白(LDL)胆固醇水平降低了27%。这验证了优化的v3emPE3-AAV系统在体内具有强大的治疗相关原位编辑能力。
v3emPE3-AAV系统的生物安全性
该系统展现出良好的生物安全性:脱靶效应方面,使用CIRCLE-seq技术评估了10个潜在的脱靶位点,未发现显著的脱靶编辑,验证了Prime编辑的高特异性;毒性评估方面,血清转氨酶(ALT、AST)水平及肝组织病理切片均未见显著异常,表明v3emPE-AAV系统不会引起明显肝毒性。
作为新一代的精准基因编辑方法,PrimeEditor展示了其独特的创新性。根据客户的需求,人生就是博-尊龙凯时可以设计个性化的epegRNA和nicking sgRNA,以实现目标基因的编辑。如果您对此有兴趣,欢迎随时咨询!
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